为了确保衡水学院教学、科研、生活的正常进行，努力做好后勤服务及保障工作，在充分考虑实际工作需要的基础上，设置5个职能科室。具体机构设置如下：
一、综合服务办公室
二、校园环境维护科
三、维修服务科
四、饮食服务科
五、校医院（疾控中心）
